José Eduardo Soto Guzmán

Ingeniería Genómica Investigador

Inv. Asoc. C T.C. Obra Det.

Semblanza

Eduardo Soto estudió la Licenciatura en Ciencias Genómicas en la UNAM, donde su investigación se enfocó en comprender la evolución de vías metabólicas bacterianas empleando un enfoque de teoría de redes. Después, continuó su formación académica obteniendo la maestría y el doctorado en Ciencias Bioquímicas en el Instituto de Fisiología Celular. Durante este período, se centró en descifrar los mecanismos moleculares detrás del funcionamiento del sistema de secreción tipo III de Escherichia coli enteropatógena. Posteriormente, formó parte del programa Pew Latin American Fellows Program in the Biomedical Sciences para continuar su investigación en la Universidad de Yale. En este período, se enfocó en dilucidar los mecanismos de patogenicidad detrás de Salmonella enterica, uno de los patógenos bacterianos transmitidos por alimentos más comúnmente reportados en México.

Actualmente, es investigador en el Centro de Ciencias Genómicas, donde su grupo se enfoca en comprender los principios básicos del funcionamiento y ensamblaje de nanomaquinarias de patogenicidad bacteriana. Específicamente, el grupo está interesado en dilucidar los mecanismos de acción de los sistemas de secreción tipo III y VI bacterianos, dos maquinarias directamente involucradas en la virulencia de bacterias patógenas. La visión a mediano plazo del laboratorio es desarrollar métodos de alto rendimiento para evaluar la relación estructura-función de estas complejas maquinarias moleculares. Con esta investigación, se busca generar conocimientos fundamentales que permitan el desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas antimicrobianas.

Estudiantes que estén interesados en emplear predicciones computacionales para generar hipótesis que luego puedan ser probadas experimentalmente, y así comprender mejor las estrategias de patogenicidad de Salmonella enterica, son más que bienvenidos a unirse a nuestro laboratorio.

Ligas

https://orcid.org/my-orcid?orcid=0000-0002-6954-479X
Google Scholar

Publicaciones selectas

1. Soto JE#, Lara-Tejero M#.
The sorting platform in the type III secretion pathway: From assembly to function.
Bioessays. 2023 Sep;45(9):e2300078. doi: 10.1002/bies.202300078. (#corresponding author).

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Assembly and architecture of the type III secretion sorting platform.
PNAS. 2022 Dec. doi: 10.1073/pnas.2218010119.

3. Kato J*, Dey S*, Soto JE*, Butan C, Wilkinson MC, De Guzman RN, Galán JE.
A protein secreted by the Salmonella type III secretion system controls needle filament assembly.
Elife. 2018 Jul 17;7. doi: 10.7554/eLife.35886. (*equal contribution).

 

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Publicaciones

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Año Publicación PMID
2023 Soto JE, Lara-Tejero M. (2023). ” The sorting platform in the type III secretion pathway: From assembly to function”. Bioessays. 45(3):1131-1147. [https://doi.org/10.1002/bies.202300078] 37329195
2022 Soto JE, Galán JE, Lara-Tejero M. (2022). “Assembly and architecture of the type III secretion sorting platform”. PNAS. 20(1):1-18. [https://doi.org/10.1073/pnas.2218010119] 36512499
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2018 Kato J*, Dey S*, Soto JE*, Butan C, Wilkinson MC, De Guzman RN, Galán JE. (2018). “A protein secreted by the Salmonella type III secretion system controls needle filament assembly”. Elife. 7:e35886. [https://doi.org/10.7554/eLife.35886] 30015613
2018 Gaytán MO, Monjarás Feria J, Soto E, Espinosa N, Benítez JM, Georgellis D, González-Pedrajo B. (2018). “Novel insights into the mechanism of SepL-mediated control of effector secretion in enteropathogenic Escherichia coli”. MicrobiologyOpen. 7(3):e00571. [https://doi.org/10.1002/mbo3.571] 29277965
2017 Soto E, Espinosa N, Díaz-Guerrero M, Gaytán MO, Puente JL, González-Pedrajo B. (2017). “Functional Characterization of EscK (Orf4), a Sorting Platform Component of the Enteropathogenic Escherichia coli Injectisome”. J Bacteriol. 199(1). [https://doi.org/10.1128/jb.00538-16] 27795324
2016 Gaytán MO, Martínez-Santos VI, Soto E, González-Pedrajo B. (2016). “Type Three Secretion System in Attaching and Effacing Pathogens”. Front Cell Infect Microbiol. 6:129. [https://doi.org/10.3389/fcimb.2016.00129] 27818950
2014 Romo-Castillo M, Andrade A, Espinosa N, Monjarás Feria J, Soto E, Díaz-Guerrero M, González-Pedrajo B. (2017). “EscO, a functional and structural analog of the flagellar FliJ protein, is a positive regulator of EscN ATPase activity of the enteropathogenic Escherichia coli injectisome”. J Bacteriol. 196(12):2227-41. [https://doi.org/10.1128/jb.01551-14] 24706741