Damien Jean-Rene Formey de Saint Louvent

Genómica Funcional de Eucariotes Investigador

Inv. Tit. A T.C. Interino

Semblanza

El Dr. Damien Formey estudió biología en la Universidad de Perpignan Via Domitia (UPVD, Francia). Se ha especializado en genómica y evolución durante su Maestría en el Laboratorio de Genoma y Desarrollo de las Plantas (LGDP – UPVD / CNRS, Francia) en el grupo del Pr. Olivier Panaud. En esta ocasión, recibió la beca de Mérito Universitario (Distinción del Ministerio Francés de Investigación y Educación Superior). En 2012, como becario CIFRE de la Agencia Nacional Francesa de Investigación y Tecnología (ANRT), completó su doctorado sobre la genómica de la interacción planta-microorganismo en la Universidad de Toulouse III Paul Sabatier (Francia), en el Laboratorio de Investigación en Ciencias Vegetales (LRSV – UT3 / CNRS, Francia) en colaboración con la empresa Agronutrition, bajo la supervisión del Pr. Christophe Roux. Gracias a una beca de la DGAPA de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), realizó un trabajo postdoctoral sobre los ARN pequeños implicados en la regulación del proceso de nodulación en el Centro de Ciencias Genómicas (CCG), en el grupo de Pr. Georgina Hernández. A fines de 2016, fundó su propio grupo de investigación como Investigador Asociado (C) en el mismo centro.

La línea de investigación del Dr. Damien Formey es la caracterización y evolución de los ARN pequeños involucrados en las interacciones planta-microorganismo. Utilizando el modelo de interacción Phaseolus vulgaris / Rhizobium, el proyecto se enfoca en los microARN y phasiARN involucrados en la regulación de la fijación simbiótica de nitrógeno, desde el intercambio de factores difusibles hasta la senescencia de los órganos simbióticos llamados nódulos. Varios de estos ARN pequeños son específicos del frijol común y proveen nuevas percepciones de la co-evolución entre las bacterias y su hospedero. Se estima que la variedad de los genotipos de Phaseolus vulgaris es de varias decenas de miles distribuidas por todo el mundo. Este grupo de frijol común representa una herramienta poderosa para la investigación de la variabilidad de los ARN pequeños al nivel intra-específico y la influencia de estas variaciones sobre el establecimiento de la fijación simbiótica de nitrógeno.

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Publicaciones

AñoPublicaciónPMID
2024Padilla-Padilla EA, De la Rosa C, Aragón W, Ávila-Sandoval AK, Torres M, Dorantes-Acosta AE, Arteaga-Vázquez MA, Formey D, Serrano M. (2024). "Identification of Arabidopsis thaliana small RNAs responsive to the fungal pathogen Botrytis cinerea at an early stage of interaction.". Plos One. 19(6):-. [doi:10.1371/journal.pone.0304790]38875250
2024Romero-Contreras YJ, González-Serrano F, Bello-López E, Formey D, Aragón W, Cevallos MÁ, Rebollar EA, Serrano M. (2024). "Bacteria from the skin of amphibians promote growth of Arabidopsis thaliana and Solanum lycopersicum by modifying hormone-related transcriptome response.". PLANT MOLECULAR BIOLOGY. 114(3):39-39. [doi:10.1007/s11103-024-01444-x]38615069
2024Romero-Contreras YJ, Gonzalez-Serrano F, Formey D, Aragón W, Chacón FI, Torres M, Cevallos MÁ, Dib JR, Rebollar EA, Serrano M. (2024). "Amphibian skin bacteria display antifungal activity and induce plant defense mechanisms against Botrytis cinerea .". Frontiers In Plant Science. 15():1392637-1392637. [doi:10.3389/fpls.2024.1392637]38654899
2024García-Soto, I., Formey, D., Mora-Toledo, A., Cárdenas, L., Aragón, W., Tromas, A., Duque-Ortiz, A., Jiménez-Bremont, J.F., Serrano, M.. (2024). "AtRAC7/ROP9 Small GTPase Regulates A. thaliana Immune Systems in Response to B. cinerea Infection.". International Journal Of Molecular Sciences. 25(1):-. [doi:10.3390/ijms25010591]38203762
2023Boussageon, R., Serrano, M., Formey, D., Tromas, A., Wipf, D., Courty, P.E.. (2023). "Knockdown of Lotus japonicus ROP3 alters the root symbiotic phenotype and alters the expression of genes involved in nutrient acquisition during both rhizobial and mycorrhizal symbioses". Symbiosis. 91(1-3):167-178. [doi:10.1007/s13199-023-00954-4]
2023Ferrer-Orgaz, S., Tiwari, M., Isidra-Arellano, M.C., Pozas-Rodriguez, E.A., Vernié, T., Rich, M.K., Mbengue, M., Formey, D., Delaux, P.M., Ané, J.M., Valdés-López, O.. (2023). "Early Phosphorylated Protein 1 is required to activate the early rhizobial infection program.". New Phytologist. 241(3):962-968. [doi:10.1111/nph.19423]38009302
2022Sánchez-Correa, M.d.S., Isidra-Arellano, M.C., Pozas-Rodríguez, E.A., Reyero-Saavedra, M.d.R., Morales-Salazar, A., del Castillo, S.M.L.C., Sanchez-Flores, A., Jiménez-Jacinto, V., Reyes, J.L., Formey, D., Valdés-López, O.. (2022). "Argonaute5 and its associated small RNAs modulate the transcriptional response during the Rhizobia- Phaseolus vulgaris symbiosis.". Frontiers In Plant Science. 13():-. [doi:10.3389/fpls.2022.1034419]36466235
2021Ángel Martín-Rodríguez, J., Ariani, A., Leija, A., Elizondo, A., Fuentes, S.I., Ramirez, M., Gepts, P., Hernández, G., Formey, D.. (2021). "Phaseolus vulgaris MIR1511 genotypic variations differentially regulate plant tolerance to aluminum toxicity.". PLANT JOURNAL. 105(6):1521-1533. [doi:10.1111/tpj.15129]33300202
2021Batista-Oliveira, J.S., Formey, D., Torres, M., Aragón, W., Romero-Contreras, Y.J., Maruri-López, I., Tromas, A., Schwan-Estrada, K.R.F., Serrano, M.. (2021). "Gadolinium Protects Arabidopsis thaliana against Botrytis cinerea through the Activation of JA/ET-Induced Defense Responses.". International Journal Of Molecular Sciences. 22(9):-. [doi:10.3390/ijms22094938]34066536
2021Aragón, W., Formey, D., Aviles-Baltazar, N.Y., Torres, M., Serrano, M.. (2021). "Arabidopsis thaliana Cuticle Composition Contributes to Differential Defense Response to Botrytis cinerea". Frontiers In Plant Science. 12():-. [doi:10.3389/fpls.2021.738949]34804086
2021García-Soto I, Boussageon R, Cruz-Farfán YM, Castro-Chilpa JD, Hernández-Cerezo LX, Bustos-Zagal V, Leija-Salas A, Hernández G, Torres M, Formey D, Courty PE, Wipf D, Serrano M, Tromas A. (2021). "The Lotus japonicus ROP3 Is Involved in the Establishment of the Nitrogen-Fixing Symbiosis but Not of the Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis.". Frontiers In Plant Science. 12():696450-696450. [doi:10.3389/fpls.2021.696450]34868100
2020Figueredo, M.S., Formey, D., Rodríguez, J., Ibáñez, F., Hernández, G., Fabra, A.. (2020). "Identification of miRNAs linked to peanut nodule functional processes.". JOURNAL OF BIOSCIENCES. 45(1):-. [doi:10.1007/s12038-020-00034-5]32385221
2019Formey, D., Martín-Rodríguez, J.Á., Hernández, G.. (2019). "Functional analysis of root microRNAs by a constitutive overexpression approach in a composite plant system". Methods in Molecular Biology. 1932():215-226. [doi:10.1007/978-1-4939-9042-9_16]30701503
2019Valdés-López, O., Formey, D., Isidra-Arellano, M.C., Reyero-Saavedra, M.D.R., Fernandez-Göbel, T.F., Sánchez-Correa, M.D.S.. (2019). "Argonaute Proteins: Why Are They So Important for the Legume–Rhizobia Symbiosis?". Frontiers In Plant Science. 10():1177-1177. [doi:10.3389/fpls.2019.01177]31632421
2018Martin-Rodriguez, Jose A., Leija, Alfonso, Formey, Damien, Hernandez, Georgina. (2018). "The MicroRNA319d/TCP10 Node Regulates the Common Bean - Rhizobia Nitrogen-Fixing Symbiosis". Frontiers In Plant Science. 9():1175-1175. [doi:10.3389/fpls.2018.01175]30147704
2018Ferreira-Saab, M., Formey, D., Torres, M., Aragón, W., Padilla, E.A., Tromas, A., Sohlenkamp, C., Schwan-Estrada, K.R.F., Serrano, M.. (2018). "Compounds released by the biocontrol yeast Hanseniaspora opuntiae protect plants against Corynespora cassiicola and Botrytis cinerea". Frontiers in Microbiology. 9(JUL):1596-1596. [doi:10.3389/fmicb.2018.01596]30065716
2016Formey, D., Martín-Rodríguez, J.Á., Leija, A., Santana, O., Quinto, C., Cárdenas, L., Hernández, G.. (2016). "Regulation of Small RNAs and Corresponding Targets in Nod Factor-Induced Phaseolus vulgaris Root Hair Cells". International Journal Of Molecular Sciences. 17(6):-. [doi:10.3390/ijms17060887]27271618
2015Formey, D., Iñiguez, L.P., Peláez, P., Li, Y.F., Sunkar, R., Sánchez, F., Reyes, J.L., Hernández, G.. (2015). "Genome-wide identification of the Phaseolus vulgaris sRNAome using small RNA and degradome sequencing". Bmc Genomics. 16(1):-. [doi:10.1186/s12864-015-1639-5]26059339

Publications from former affiliations

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Año Publicación PMID
2014 Formey, D, Sallet, E, Lelandais-Brière, C, Ben, C, Bustos-Sanmamed, P, Niebel, A, Frugier, F, Combier, J, Debellé, F, Hartmann, C, Poulain, J, Gavory, F, Wincker, P, Roux, C, Gentzbittel, L, Gouzy, J, Crespi, M. (2014). “The small RNA diversity from Medicago truncatula roots under biotic interactions evidences the environmental plasticity of the miRNAome”. Genome Biology. 15(9):-. [doi:10.1186/s13059-014-0457-4] 25248950
2012 Formey, D, Molès, M, Haouy, A, Savelli, B, Bouchez, O, Bécard, G, Roux, C. (2012). “Comparative analysis of mitochondrial genomes of Rhizophagus irregularis – syn. Glomus irregulare – reveals a polymorphism induced by variability generating elements”. New Phytologist. 196(4):1217-1227. [doi:10.1111/j.1469-8137.2012.04283.x] 22967288
2012 Lauressergues, D, Delaux, P, Formey, D, Lelandais-Brière, C, Fort, S, Cottaz, S, Bécard, G, Niebel, A, Roux, C, Combier, J. (2012). “The microRNA miR171h modulates arbuscular mycorrhizal colonization of Medicago truncatula by targeting NSP2″. PLANT JOURNAL. 72(3):512-522. [doi:10.1111/j.1365-313X.2012.05099.x] 22775306
2012 Formey, D, Jourda, C, Roux, C, Delaux, P. (2012). “What the Genomics of Arbuscular Mycorrhizal Symbiosis Teaches Us about Root Development”. Root Genomics And Soil Interactions. ():171-188. [doi:10.1002/9781118447093.ch9]  
2012 Tisserant, E, Kohler, A, Dozolme-Seddas, P, Balestrini, R, Benabdellah, K, Colard, A, Croll, D, da Silva, C, Gomez, S, Koul, R, Ferrol, N, Fiorilli, V, Formey, D, Franken, P, Helber, N, Hijri, M, Lanfranco, L, Lindquist, E, Liu, Y, Malbreil, M, Morin, E, Poulain, J, Shapiro, H, van Tuinen, D, Waschke, A, Azcón-Aguilar, C, Bécard, G, Bonfante, P, Harrison, M, Küster, H, Lammers, P, Paszkowski, U, Requena, N, Rensing, S, Roux, C, Sanders, I, Shachar-Hill, Y, Tuskan, G, Young, J, Gianinazzi-Pearson, V, Martin, F. (2012). “The transcriptome of the arbuscular mycorrhizal fungus Glomus intraradices (DAOM 197198) reveals functional tradeoffs in an obligate symbiont”. New Phytologist. 193(3):755-769. [doi:10.1111/j.1469-8137.2011.03948.x] 22092242
2011 Maillet, F, Poinsot, V, André, O, Puech-Pagés, V, Haouy, A, Gueunier, M, Cromer, L, Giraudet, D, Formey, D, Niebel, A, Martinez, E, Driguez, H, Bécard, G, Dénarié, J. (2011). “Fungal lipochitooligosaccharide symbiotic signals in arbuscular mycorrhiza”. Nature. 469(7328):58-64. [doi:10.1038/nature09622] 21209659
2009 Picault, N, Chaparro, C, Piegu, B, Stenger, W, Formey, D, Llauro, C, Descombin, J, Sabot, F, Lasserre, E, Meynard, D, Guiderdoni, E, Panaud, O. (2009). “Identification of an active LTR retrotransposon in rice”. PLANT JOURNAL. 58(5):754-765. [doi:10.1111/j.1365-313X.2009.03813.x] 19187041