Alejandro García de los Santos

Ingeniería Genómica Investigador

Inv. Tit. A T.C. Interino

Semblanza

Dr. Alejandro García de los Santos, Investigador Titular A de tiempo completo en el Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM.
El Dr. Alejandro García de los Santos inició su carrera científica en la Facultad de Ciencias de la UNAM donde estudió Biología. En su tesis de licenciatura estudió la degradación de celulosa por enzimas microbianas. Posteriormente, recibió la oportunidad de trabajar en Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno (hoy Centro de Ciencias Genómicas de la UNAM) para organizar el cepario del departamento de genética molecular. Más tarde, comenzó a trabajar con la Dra. Susana Brom estudiando el papel de los plásmidos en la plasticidad genómica de la bacteria fijadora de nitrógeno Rhizobium etli. También contribuyó en el aislamiento de mutantes de Rhizobium etli que espontáneamente pierden plásmidos a alta frecuencia. La Dra. Susana Brom dirigió su tesis de doctorado en la cual caracterizo dos genes indispensables para la síntesis de lipopolisacárido (lps) un componente de la membrana externa necesario para la colonización de su planta hospedera.
Sus estudios posdoctorales los llevó a cabo en la Universidad de Calgary en Canadá en el laboratorio de Michael Hynes buscando genes de Rhizobium leguminosarum cuya expresión genética es activada por azúcares presentes en la pared celular de su planta hospedera.
De regreso al laboratorio de la Dra. Brom, Alejandro y sus colegas descubrieron la presencia de enzimas del metabolismo primario codificados en plásmidos, algo inusual ya que estos genes se localizan en el cromosoma. Estos datos contribuyeron a definir un nuevo tipo de replicón denominado cromido. El estudio de las vías metabólicas de los rhizobios reveló la ausencia de algunas enzimas claves de la síntesis de vitaminas. Actualmente, Alejandro está reconstruyendo la vía de síntesis de pantotenato.
En los últimos cinco años, el trabajo del Dr. Alejandro se ha centrado en caracterizar el transportoma de iones metálicos divalentes (el repertorio de proteínas que participan en el ingreso, tráfico interno y expulsión de metales). Las publicaciones más recientes del grupo del Dr. García reportan la caracterización de los genes que codifican transportadores de la familia CDF ( catión diffusion facilitators) que transportan niquel, cobalto y manganeso. También reportó una proteína tipo porina que participa en el ingreso de cobre en R. etli y un análisis in sílico sobre la ocurrencia, diversidad y evolución de ATPasas de tipo PIB en el orden Rhizobiales.
Los nuevos proyectos del Dr. García tienen como meta hacer un análisis global de la respuesta a metales utilizando RNA seq bajo la hipótesis de que la interacción metal-bacteria induce cambios a diferentes niveles de la estructura celular: polisacáridos de superficie, membrana externa, espacio periplásmico, membrana interna, citoplasma, etc.

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Publicaciones

AñoPublicaciónPMID
2023Dávalos A, Lozano-Aguirre Beltrán LF, García-de Los Santos A. (2023). "Draft genome sequence of the highly copper-tolerant Methylobacterium radiotolerans MLP1 isolated from the rhizosphere of grasses adjacent to mine tailings.". Microbiology Resource Announcements. ():-. [doi:10.1128/MRA.00361-23]37638742
2023Dávalos, A., García-De los Santos, A.. (2023). "Five copper homeostasis gene clusters encode the Cu-efflux resistome of the highly copper-tolerant Methylorubrum extorquens AM1.". Peerj. 11():-. [doi:10.7717/peerj.14925]36846457
2020López-Sámano, M., Beltrán, L.F.L.A., Sánchez-Thomas, R., Dávalos, A., Villaseñor, T., García-García, J.D., García-de los Santos, A.. (2020). "A novel way to synthesize pantothenate in bacteria involves ß-alanine synthase present in uracil degradation pathway". MICROBIOLOGYOPEN. 9(4):-. [doi:10.1002/mbo3.1006]32112625
2019Elizalde-Díaz JP, Hernández-Lucas I, Medina-Aparicio L, Dávalos A, Leija A, Alvarado-Affantranger X, García-García JD, Hernández G, Garcia-de Los Santos A. (2019). "Rhizobium tropici CIAT 899 copA gene plays a fundamental role in copper tolerance in both free life and symbiosis with Phaseolus vulgaris.". MICROBIOLOGY-SGM. 165(6):651-661. [doi:10.1099/mic.0.000803]31081746
2018González-Sánchez A, Cubillas CA, Miranda F, Dávalos A, García-de Los Santos A. (2018). "The ropAe gene encodes a porin-like protein involved in copper transit in Rhizobium etli CFN42". MICROBIOLOGYOPEN. 7(3):-. [doi:10.1002/mbo3.573]29280343
2017Cubillas, C., Miranda-Sánchez, F., González-Sánchez, A., Elizalde, J.P., Vinuesa, P., Brom, S., García-de los Santos, A.. (2017). "A comprehensive phylogenetic analysis of copper transporting P1BATPases from bacteria of the Rhizobiales order uncovers multiplicity, diversity and novel taxonomic subtypes". MICROBIOLOGYOPEN. 6(4):-. [doi:10.1002/mbo3.452]28217917
2014Cubillas, Ciro, Vinuesa, Pablo, Tabche, Maria Luisa, Davalos, Araceli, Vazquez, Alejandra, Hernandez-Lucas, Ismael, Romero, David, Garcia-de los Santos, Alejandro. (2014). "The cation diffusion facilitator protein EmfA of Rhizobium etli belongs to a novel subfamily of Mn<sup>2+</sup>/Fe<sup>2+</sup> transporters conserved in a-proteobacteria". Metallomics. 6(10):1808-1815. [doi:10.1039/c4mt00135d]25054342
2014Chang, F.M.J., Coyne, H.J., Cubillas, C., Vinuesa, P., Fang, X.Y., Ma, Z., Ma, D.J., Helmann, J.D., García, A., Wang, Y.X., Dann, C.E., Giedroc, D.P.. (2014). "Cu(I)-mediated allosteric switching in a copper-sensing operon repressor (CsoR)". JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 289(27):19204-19217. [doi:10.1074/jbc.M114.556704]24831014
2013Cubillas, C., Vinuesa, P., Tabche, M.L., García, A.. (2013). "Phylogenomic analysis of Cation Diffusion Facilitator proteins uncovers Ni2+/Co2+ transporters". Metallomics. 5(12):1634-1643. [doi:10.1039/c3mt00204g]24077251
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2003Vargas, MD, Encarnacion, S, Davalos, A, Reyes-Perez, A, Mora, Y, Garcia-de los Santos, A, Brom, S, Moral, J. (2003). "Only one catalase, katG, is detectable in Rhizobium etli, and is encoded along with the regulator OxyR on a plasmid replicon". MICROBIOLOGY-SGM. 149(5):1165-1176. [doi:10.1099/mic.0.25909-0]12724378
2002Garcia-de los Santos, A, Morales, A, Baldoma, L, Clark, SRD, Brom, S, Yost, CK, Hernandez-Lucas, I, Aguilar, J, Hynes, MF. (2002). "The glcB locus of Rhizobium leguminosarum VF39 encodes an arabinose-inducible malate synthase". Canadian Journal Of Microbiology. 48(10):922-932. [doi:10.1139/w02-091]12489782
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2000Brom, S, Garcia-de los Santos, A, Cervantes, L, Palacios, R, Romero, D. (2000). "In Rhizobium etli symbiotic plasmid transfer, nodulation competitivity and cellular growth require interaction among different replicons". Plasmid. 44(1):34-43. [doi:10.1006/plas.2000.1469]10873525
1999Wang, ET, Roel, MA, Garcia-de los Santos, A, Martinez-Romero, Julio, Cevallos, MA, Martinez-Romero, E. (1999). "Rhizobium etli bv. mimosae, a novel biovar isolated from Mimosa affinis". INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC BACTERIOLOGY. 49(4):1479-1491. [doi:10.1099/00207713-49-4-1479]10555329
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